Mặc dù telemedicine mang lại nhiều tiện ích, nhưng cũng tồn tại những hạn chế và rủi ro cần lưu ý. Một số tình trạng bệnh cần thăm khám trực tiếp, xét nghiệm hoặc chẩn đoán hình ảnh mà telemedicine không thể thay thế hoàn toàn. Ví dụ như các ca phẫu thuật, chấn thương nghiêm trọng hoặc bệnh lý cấp tính đòi hỏi bác sĩ trực tiếp quan sát và thao tác.
Ngoài ra, vấn đề bảo mật dữ liệu là một thách thức quan trọng. Việc trao đổi thông tin y tế qua mạng có nguy cơ rò rỉ dữ liệu hoặc bị xâm nhập nếu không sử dụng nền tảng uy tín và bảo mật cao. Thêm vào đó, việc chẩn đoán dựa trên hình ảnh, video hoặc mô tả của bệnh nhân đôi khi thiếu chính xác so với thăm khám trực tiếp.
Tuy nhiên, nhận biết những hạn chế này giúp bệnh nhân sử dụng telemedicine một cách an toàn và hiệu quả. Telemedicine nên được coi là công cụ hỗ trợ, kết hợp với thăm khám trực tiếp khi cần thiết. Khi sử dụng đúng cách, bệnh nhân vẫn có thể tận dụng lợi ích của telemedicine mà giảm thiểu rủi ro tiềm ẩn.